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开发RICK技术首次分离RNA结合蛋白 首页 > 科学研究 > 科研进展

呼吸疾病国家重点实验室,中国科学院广州生物医药与健康研究院的张必良教授团队与Miguel A. Esteban(米格尔·埃斯特班)研究员和鲍习琛副研究员领衔的科研团队合作,通过RICK技术首次分离了RNA结合蛋白,该技术是全面分析细胞内的RNA-蛋白相互作用的重要工具,有助于揭开基因组中的“暗物质”-非编码RNA的未知功能。 

有数以百计的蛋白质可以与RNA结合,其中很多涉及神经退行性病变、自身免疫缺陷和癌症等疾病。那么,如何系统地分离RNA结合蛋白的问题变得引人注目。前期科学家们系统地分离了细胞内mRNA结合蛋白,这只是众多转录本中的一部分,细胞还包含了很多非polyA RNA。 本文设计了RICK(Newly Transcribed RNA interactome using click chemistry)技术,插入核算类似物EU于新合成RNA,利用“点击”反应将新合成的RNA标记上生物素,并通过链霉亲和素偶联的磁珠,分离得到相应被标记RNA分子和与其相结合的蛋白分子。 利用这一新技术,研究人员系统地分离了包括非polyA尾RNA和新生RNA在内的一系列RNA分子及其结合蛋白,并进一步地分析发现,细胞分裂调控因子可作为新的RNA结合蛋白,存在结合非polyA尾RNA的潜能。


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rick技术原理图


研究人员缩短标记的时间,成功地在细胞中分离了新生RNA结合蛋白。这些蛋白与新生RNA的转录及后续的加工、剪切等调控密切相关。这一技术的应用将有助于深入地剖析RNA结合蛋白的作用机制,也是细胞命运转变过程中分析RNA蛋白相互作用的重要工具。 

研究工作还同时获得国家重点研发计划项目、国家自然科学基金委、广州珠江科技新星、中科院青年创新促进会等项目的资助。研究成果已于2018年2月13日成功在线发表在Nature Methods(《自然-方法学》)杂志。

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